Terminal Kedatangan di Bandar Udara Sepinggan terdiri dari  2 (dua) bagian, yaitu Terminal Kedatangan Domestik dan Terminal Kedatangan Internasional. Pelayanan bagi penumpang datang/ tiba dari pesawat menggunakan transportasi Bus Apron menuju ke Terminal Kedatangan dan untuk barang dan bagasi diangkut menggunakan gerobak barang menuju baggage claim area.

Bagi penumpang yang akan menggambil barang bagasi dapat dilakukan di Baggage Conveyor  yang telah tersedia. Sebelum meninggalkan ruang tunggu kedatangan untuk penumpang dengan membawa bagasi akan dilakukan pengechekan dan pencocokan  pada baggage tag yang ditempel pada barang dengan baggage claim yang dibawa oleh penumpang oleh petugas operator penerbangan (Airline Operator).

Penumpang yang akan melanjutkan perjalanan dengan menggunakan moda transportasi darat, tersedia Taksi Bandara (Airport Taxi service) fasilitas A/C dengan menggunakan tarif resmi, tersedia di lobby terminal kedatangan.

Tarif Taksi Bandara (Airport Taxi Service) adalah sebagai berikut:

• Taksi Kokapura (Airport Taxi) - Telp. 76686/ Ext 877 atau 7010011

Wilayah kota Balikpapan Ring I : Rp. 24.000,-- (untuk satu tujuan)

Wilayah kota Balikpapan Ring II: Rp. 27.000,-- (untuk satu tujuan)

Taksi tujuan luar kota Balikpapan;

• Taksi Globalindo

• Taksi Kalung Mas

• Taksi Mawar

Bandara Sepinggan - Samarinda : Rp.175.000,--

Bandara Sepinggan - Tenggarong: Rp 225.000,--

Bandara Sepinggan - Bontang : Rp.350.000,--

Bandara Sepinggan - Badak : Rp.275.000,--

Bandara Sepinggan - Handil : Rp.175.000,--

Bandara Sepinggan - Sangatta : Rp.500.000,--

Bagi penumpang yang menggunakan mobil pribadi tersedia area penjemputan (pick-up zone) di sebelah kiri lobby terminal kedatangan.

Untuk proses kedatangan pada Penerbangan Internasional dilakukan pemeriksaan dokumen perjalanan (document clearance) dari beberapa instansi terkait seperti: Bea Cukai (Custom), Imigrasi (Immigration) dan Karantina (Quarantine).

Fasilitas Terminal Kedatangan:

Terminal  Kedatangan Domestik.

Terminal  Kedatangan Internasional.

Baggage Claim Area.

Baggage Conveyor.

Lost & Found.

Counter Penumpang Transit (Transfer Desk).

Commercial Transit Lounge (Blue Sky Hotel)).

Ruang Pemeriksaan Bagasi.

Counter Bea Cukai/ Custom - (Int'l Flt).

Counter Imigarsi - (Int'l Flt).

Counter Karantina Kesehatan _ (Int'l Flt).

Lobby Kedatangan.

Counter Taxi Service.

Area penjemputan (Pick-up zone)

Penukaran Mata Uang ( Money Changer)