Pra Kemerdekaan
Digunakan untuk kegiatan perusahaan minyak Belanda (BPM).

Tahun 1960
Diserahkan operasionalnya ke Jawatan Penerbangan Sipil, selanjutnya disebut Direktorat Jendral Perhubungan Udara.

Tahun 1987

Sesuai PP no. 1 tahun 1987 tanggal 9 Januari1987 pengelolaan Bandara dialihkan ke Perum Angkasa Pura I.

Tahun 1991 s/d 1994
Pelaksanaan proyek pengembangan Fasilitas Bandar Udara dan Keselamatan Penerbangan tahap I, untuk pekerjaan fisik terdiri dari: landasan pacu (Runway), landasan hubung (taxy way), apron, terminal penumpang dan terminal barang, serta fasilitas penunjang keselamatan penerbangan.

Tahun 1992
Sesuai Peraturan Pemerintah PP. No. 5 tahun 1992   tanggal 4 Pebruari 1992, perubahan status dari Perusahaan Umum Angkasa Pura I menjadi PT. (Persero) Angkasa Pura I.

Tahun 1993
Tanggal 20 Agustus 1993 uji coba pengoperasian (shadow operation) Bandara Sepinggan yang baru (new airport) Pada tanggal 6 September 1993 pengoperasian secara penuh (Full Operation) Bandara Sepinggan yang baru di Jl. Marsma. R. Iswahyudi Balikpapan.

Tahun 1995
Bandar Udara Sepinggan Balikpapan ditetapkan sebagai Bandar Udara Embarkasi Haji yang ke V, yang meliputi Kalimantan Timur, Kalimantan Tengah dan Kalimantan Selatan.

Tahun 1996 s/d 1997
Pelaksanaan proyek pengembangan Fasilitas Bandar Udara dan Keselamatan Penerbangan tahap II, untuk pekerjaan fisik terdiri dari: hanggar, depot pengisian bahan bakar pesawat udata (DPPU) dan gedung administrasi.

Tahun 1997

Pada tanggal 6 Agustus 1997 Bandara Internasional Sepinggan Balikpapan diresmikan oleh Presiden Republik Indonesia- Soeharto.

Tahun 2011

Bulan Juli 2011 dimulai pengembangan Bandara Internasional Sepinggan Balikpapan, khususnya pembangunan terminal penumpang yang dapat menampung 10 juta penumpang per tahun dan area parkir dapat menampung 2.752 kendaraan bermotor serta sarana penumpang lainnya.

Tahun 2012

Tanggal 1 Agustus 2012 kegiatan operasional Terminal Kargo mulai dipindahkan ke Terminal Kargo Baru, Gedung Terminal Kargo salah satu sarana penunjang dari rencana Proyek Pengembangan Bandara Internasional Sepinggan Balikpapan.

Tahun 2012

Tanggal 26 Desember 2012 Kantor Administrasi, Keuangan & Komersial pindah ke kantor Baru di Gedung berlantai dua yang telah selesai dibangun sebagai fasilitas pendukung Proyek Pengembangan Bandara Internasional Sepinggan Balikpapan.